Bourne kembali dibawa keluar dari persembunyiannya oleh reporter Simon Ross yang mencoba mengungkap Operasi Blackbriar, peningkatan dari Proyek Treadstone, dalam serangkaian kolom surat kabar. Informasi dari reporter tersebut membangkitkan serangkaian kenangan baru, dan Bourne akhirnya harus mengungkap masa lalunya yang kelam sambil menghindari upaya terbaik The Company untuk membasminya.